Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmeff1Q6PFE7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms