Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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