Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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