Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Krt40Q6IFX3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Krt40Q6IFX3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms