Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop58Q6DFW4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms