Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg9aQ68FE2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms