Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Ccdc18Q640L5 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Ccdc18Q640L5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Ccdc18Q640L5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Ccdc18Q640L5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Ccdc18Q640L5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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