Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AtmQ62388 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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