Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Taf6Q62311 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms