Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp7Q60973 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms