Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf3Q60765 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms