Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mdc1Q5PSV9 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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