Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Fam208bQ5DTT3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms