Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm28047Q3US59 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm28047Q3US59 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm28047Q3US59 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm28047Q3US59 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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