Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms