Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp19Q3UJD6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp19Q3UJD6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp19Q3UJD6 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp19Q3UJD6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp19Q3UJD6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp19Q3UJD6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms