Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms