Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ssbp4Q3U4B1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ssbp4Q3U4B1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ssbp4Q3U4B1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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