Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms