Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NfiaQ02780 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NfiaQ02780 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms