Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms