Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx2P81066 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms