Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cxcr4P70658 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcr4P70658 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms