Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hoxd13P70217 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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