Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms