Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Ccpg1-202ENSMUST00000085350 2969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sem1P60897 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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