Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csrnp3P59055 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms