Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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