Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CckbrP56481 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CckbrP56481 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms