Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sh3bp1P55194 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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