Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lbx1P52955 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms