Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VdrP48281 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VdrP48281 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms