Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms