Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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