Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Upk2P38575 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Upk2P38575 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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