Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HexaP29416 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HexaP29416 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HexaP29416 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HexaP29416 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HexaP29416 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HexaP29416 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HexaP29416 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms