Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PrkcdP28867 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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