Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtprmP28828 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtprmP28828 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtprmP28828 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtprmP28828 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtprmP28828 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtprmP28828 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PtprmP28828 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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