Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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