Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hoxd8P23463 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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