Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms