Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms