Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
P18528 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
P18528 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
P18528 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms