Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Sptan1P16546 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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