Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01851 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01851 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01851 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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