Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01680 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01680 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01680 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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