Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms