Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms