Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Alx4O35137 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Alx4O35137 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms