Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Rbm26-204ENSMUST00000163545 3270 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Spdye4b-201ENSMUST00000031574 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Gm38365-201ENSMUST00000195720 2993 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Dhx35-201ENSMUST00000029186 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Gm38340-201ENSMUST00000195039 4008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcshO08795 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm5315-201ENSMUST00000204430 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm46404-201ENSMUST00000221461 4114 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Uqcc1-204ENSMUST00000109636 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Gm12116-201ENSMUST00000131851 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcshO08795 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms